Mitä eroa on 16s rRNA:lla ja 18s RRNA:lla?
Mitä eroa on 16s rRNA:lla ja 18s RRNA:lla?

Video: Mitä eroa on 16s rRNA:lla ja 18s RRNA:lla?

Video: Mitä eroa on 16s rRNA:lla ja 18s RRNA:lla?
Video: Чимаманда Адичи: Опасность единственной точки зрения 2024, Joulukuu
Anonim

Pää ero välillä analyysien tekeminen 18S rRNA geenitiedot sen sijaan 16S rRNA geenidata (tai ITS-data) on viitetietokanta, jota käytetään OTU:n poimimiseen, taksonomisiin tehtäviin ja mallipohjaiseen kohdistuksen rakentamiseen, koska sen täytyy sisältää eukaryoottisia sekvenssejä.

Kun tämä otetaan huomioon, miksi 16s rRNA-geeniä käytetään tunnistamiseen?

The 16S ribosomin RNA-geeni koodaa bakteeriribosomin 30S-alayksikön RNA-komponenttia. DNA-DNA-hybridisaation monimutkaisuuden vuoksi 16S rRNA-geeni sekvensointi on käytetty työkaluna siihen tunnistaa bakteerit lajitasolla ja auttavat erottamaan läheisiä bakteerilajeja [8].

Lisäksi, onko eukaryooteilla 16s rRNA:ta? The 16S rRNA geeniä esiintyy kaikissa bakteereissa, ja samankaltainen muoto esiintyy kaikissa soluissa, mukaan lukien eukaryootit.

Kysymys kuuluu myös, mikä on 18s ja 28s rRNA?

The 28S / 18S ribosomaalinen RNA -suhdetta käytetään usein arvioimaan mistä tahansa tietystä näytteestä puhdistetun kokonais-RNA:n laatua. ihmisissä, 28S rRNA siinä on ~ 5070 nukleotidia ja 18S siinä on 1869 nukleotidia, mikä antaa a 28S / 18S suhde ~2,7. Korkea 28S / 18S suhde on osoitus siitä, että puhdistettu RNA on ehjä eikä ole hajonnut.

Mikä on 16s rRNA-sekvensointi?

16S rRNA geeni järjestys analyysi on standardimenetelmä bakteerien taksonomiassa ja tunnistamisessa, ja se perustuu havaitsemiseen järjestys erot (polymorfismit) hypervariaabelilla alueilla 16S rRNA geeni, joka on läsnä kaikissa bakteereissa.

Suositeltava: