Mikä on Pcoa?
Mikä on Pcoa?

Video: Mikä on Pcoa?

Video: Mikä on Pcoa?
Video: Doctors Too Often Ignore PCOS 2024, Saattaa
Anonim

PCoA on skaalaus- tai ordinaatiomenetelmä, joka alkaa samankaltaisuuksien tai eroavaisuuksien matriisista yksilöiden joukon välillä ja jonka tavoitteena on tuottaa tiedoista pieniulotteinen graafinen käyrä siten, että kaavion pisteiden väliset etäisyydet ovat lähellä alkuperäisiä eroja.

Samoin mikä on PCoA-analyysi?

Pääkoordinaatit Analyysi ( PCoA , = Moniulotteinen skaalaus, MDS) on menetelmä tietojen yhtäläisyyksien tai eroavaisuuksien tutkimiseen ja visualisointiin. Se alkaa samankaltaisuusmatriisilla tai erilaisuusmatriisilla (= etäisyysmatriisi) ja määrittää kullekin kohteelle sijainnin pieniulotteisessa tilassa, esim. 3D-grafiikkana.

Tiedätkö myös, mikä on vihkimisjuoni? Könokliini on graafinen esitys kaikista lajien vastefunktioista yhteisössä piirrettynä yhden ympäristögradientin mukaan. Ottaen huomioon suuren lajimäärän ja suuren melun useimmissa tutkimuksissa, koenokliinit esitetään yleensä vain erittäin yksinkertaistetussa muodossa.

Toiseksi, mitä eroa on PCA:lla ja PCoA:lla?

Sillä aikaa PCA perustuu euklidisiin etäisyyksiin, PCoA pystyy käsittelemään kvantitatiivisista, puolikvantitatiivisista, kvalitatiivisista ja sekamuuttujista laskettuja (eri)matriiseja. Kuten aina, (epä)samankaltaisuusmitan valinta on kriittinen ja sen on oltava sopiva kyseiseen tietoon.

Mitä on ei-metrinen moniulotteinen skaalaus?

Ei - metrinen moniulotteinen skaalaus (NMDS) on epäsuora gradienttianalyysimenetelmä, joka tuottaa etäisyys- tai erilaisuusmatriisiin perustuvan ordinoinnin. Mitä tahansa eroavaisuuskerrointa tai etäisyyden mittaa voidaan käyttää syötteenä käytettävän etäisyysmatriisin rakentamiseen. NMDS on sijoitusperusteinen lähestymistapa.

Suositeltava: